Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX5

NPDC1, Neural proliferation differentiation and control protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPDC1Q9NQX5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPDC1Q9NQX5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPDC1Q9NQX5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPDC1Q9NQX5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPDC1Q9NQX5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPDC1Q9NQX5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPDC1Q9NQX5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPDC1Q9NQX5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPDC1Q9NQX5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPDC1Q9NQX5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPDC1Q9NQX5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPDC1Q9NQX5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPDC1Q9NQX5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPDC1Q9NQX5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPDC1Q9NQX5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPDC1Q9NQX5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPDC1Q9NQX5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NPDC1Q9NQX5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NPDC1Q9NQX5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NPDC1Q9NQX5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NPDC1Q9NQX5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPDC1Q9NQX5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NPDC1Q9NQX5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPDC1Q9NQX5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPDC1Q9NQX5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPDC1Q9NQX5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NPDC1Q9NQX5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPDC1Q9NQX5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPDC1Q9NQX5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPDC1Q9NQX5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPDC1Q9NQX5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPDC1Q9NQX5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPDC1Q9NQX5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPDC1Q9NQX5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPDC1Q9NQX5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPDC1Q9NQX5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPDC1Q9NQX5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPDC1Q9NQX5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPDC1Q9NQX5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPDC1Q9NQX5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NPDC1Q9NQX5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPDC1Q9NQX5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPDC1Q9NQX5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPDC1Q9NQX5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPDC1Q9NQX5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPDC1Q9NQX5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPDC1Q9NQX5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPDC1Q9NQX5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms