Protein–RNA interactions for Protein: Q9H841

NIPAL2, NIPA-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL2Q9H841 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPAL2Q9H841 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPAL2Q9H841 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NIPAL2Q9H841 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPAL2Q9H841 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NIPAL2Q9H841 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPAL2Q9H841 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPAL2Q9H841 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPAL2Q9H841 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPAL2Q9H841 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPAL2Q9H841 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPAL2Q9H841 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPAL2Q9H841 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPAL2Q9H841 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPAL2Q9H841 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPAL2Q9H841 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPAL2Q9H841 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPAL2Q9H841 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPAL2Q9H841 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPAL2Q9H841 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPAL2Q9H841 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPAL2Q9H841 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPAL2Q9H841 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPAL2Q9H841 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPAL2Q9H841 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPAL2Q9H841 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPAL2Q9H841 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms