Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms