Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCSER1Q9C0I3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCSER1Q9C0I3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CCSER1Q9C0I3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCSER1Q9C0I3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCSER1Q9C0I3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCSER1Q9C0I3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
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