Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM3Q9BZL3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM3Q9BZL3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM3Q9BZL3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM3Q9BZL3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM3Q9BZL3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM3Q9BZL3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM3Q9BZL3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM3Q9BZL3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM3Q9BZL3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM3Q9BZL3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM3Q9BZL3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM3Q9BZL3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM3Q9BZL3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM3Q9BZL3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM3Q9BZL3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM3Q9BZL3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMIM3Q9BZL3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMIM3Q9BZL3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM3Q9BZL3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM3Q9BZL3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM3Q9BZL3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM3Q9BZL3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM3Q9BZL3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM3Q9BZL3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM3Q9BZL3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM3Q9BZL3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM3Q9BZL3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM3Q9BZL3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM3Q9BZL3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM3Q9BZL3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMIM3Q9BZL3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM3Q9BZL3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM3Q9BZL3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM3Q9BZL3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM3Q9BZL3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SMIM3Q9BZL3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM3Q9BZL3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM3Q9BZL3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMIM3Q9BZL3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM3Q9BZL3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM3Q9BZL3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM3Q9BZL3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM3Q9BZL3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM3Q9BZL3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM3Q9BZL3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM3Q9BZL3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM3Q9BZL3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMIM3Q9BZL3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMIM3Q9BZL3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM3Q9BZL3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM3Q9BZL3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM3Q9BZL3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM3Q9BZL3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM3Q9BZL3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM3Q9BZL3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM3Q9BZL3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM3Q9BZL3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM3Q9BZL3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM3Q9BZL3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM3Q9BZL3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms