Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC94Q9BW85 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC94Q9BW85 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC94Q9BW85 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC94Q9BW85 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC94Q9BW85 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC94Q9BW85 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC94Q9BW85 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC94Q9BW85 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC94Q9BW85 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC94Q9BW85 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC94Q9BW85 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC94Q9BW85 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC94Q9BW85 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC94Q9BW85 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC94Q9BW85 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC94Q9BW85 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC94Q9BW85 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC94Q9BW85 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC94Q9BW85 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC94Q9BW85 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC94Q9BW85 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC94Q9BW85 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC94Q9BW85 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC94Q9BW85 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC94Q9BW85 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC94Q9BW85 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC94Q9BW85 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC94Q9BW85 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC94Q9BW85 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC94Q9BW85 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC94Q9BW85 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC94Q9BW85 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC94Q9BW85 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC94Q9BW85 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC94Q9BW85 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC94Q9BW85 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC94Q9BW85 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC94Q9BW85 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC94Q9BW85 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC94Q9BW85 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC94Q9BW85 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC94Q9BW85 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC94Q9BW85 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC94Q9BW85 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC94Q9BW85 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC94Q9BW85 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC94Q9BW85 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC94Q9BW85 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC94Q9BW85 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC94Q9BW85 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC94Q9BW85 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC94Q9BW85 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC94Q9BW85 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC94Q9BW85 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC94Q9BW85 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC94Q9BW85 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC94Q9BW85 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC94Q9BW85 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC94Q9BW85 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC94Q9BW85 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC94Q9BW85 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC94Q9BW85 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC94Q9BW85 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC94Q9BW85 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC94Q9BW85 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC94Q9BW85 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC94Q9BW85 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC94Q9BW85 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC94Q9BW85 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC94Q9BW85 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC94Q9BW85 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
CCDC94Q9BW85 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC94Q9BW85 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC94Q9BW85 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC94Q9BW85 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC94Q9BW85 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC94Q9BW85 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC94Q9BW85 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC94Q9BW85 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC94Q9BW85 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC94Q9BW85 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC94Q9BW85 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC94Q9BW85 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC94Q9BW85 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC94Q9BW85 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC94Q9BW85 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC94Q9BW85 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC94Q9BW85 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC94Q9BW85 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC94Q9BW85 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC94Q9BW85 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC94Q9BW85 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC94Q9BW85 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC94Q9BW85 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC94Q9BW85 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC94Q9BW85 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC94Q9BW85 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC94Q9BW85 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC94Q9BW85 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.1 ms