Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NPAS2Q99743 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPAS2Q99743 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPAS2Q99743 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPAS2Q99743 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPAS2Q99743 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPAS2Q99743 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NPAS2Q99743 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPAS2Q99743 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPAS2Q99743 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPAS2Q99743 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPAS2Q99743 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPAS2Q99743 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPAS2Q99743 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPAS2Q99743 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPAS2Q99743 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPAS2Q99743 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPAS2Q99743 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPAS2Q99743 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NPAS2Q99743 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPAS2Q99743 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPAS2Q99743 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPAS2Q99743 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPAS2Q99743 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NPAS2Q99743 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPAS2Q99743 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NPAS2Q99743 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPAS2Q99743 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPAS2Q99743 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NPAS2Q99743 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPAS2Q99743 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPAS2Q99743 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NPAS2Q99743 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NPAS2Q99743 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NPAS2Q99743 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPAS2Q99743 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPAS2Q99743 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPAS2Q99743 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPAS2Q99743 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPAS2Q99743 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPAS2Q99743 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPAS2Q99743 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPAS2Q99743 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPAS2Q99743 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPAS2Q99743 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPAS2Q99743 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPAS2Q99743 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPAS2Q99743 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPAS2Q99743 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPAS2Q99743 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPAS2Q99743 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPAS2Q99743 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPAS2Q99743 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NPAS2Q99743 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPAS2Q99743 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPAS2Q99743 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPAS2Q99743 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPAS2Q99743 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPAS2Q99743 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NPAS2Q99743 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPAS2Q99743 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPAS2Q99743 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPAS2Q99743 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPAS2Q99743 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPAS2Q99743 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPAS2Q99743 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPAS2Q99743 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPAS2Q99743 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPAS2Q99743 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NPAS2Q99743 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPAS2Q99743 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPAS2Q99743 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPAS2Q99743 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPAS2Q99743 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPAS2Q99743 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPAS2Q99743 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NPAS2Q99743 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPAS2Q99743 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NPAS2Q99743 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPAS2Q99743 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPAS2Q99743 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NPAS2Q99743 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NPAS2Q99743 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPAS2Q99743 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPAS2Q99743 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPAS2Q99743 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPAS2Q99743 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPAS2Q99743 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPAS2Q99743 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPAS2Q99743 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPAS2Q99743 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPAS2Q99743 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NPAS2Q99743 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NPAS2Q99743 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPAS2Q99743 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPAS2Q99743 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPAS2Q99743 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPAS2Q99743 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPAS2Q99743 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPAS2Q99743 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms