Protein–RNA interactions for Protein: Q99643

SDHC, Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHCQ99643 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDHCQ99643 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDHCQ99643 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDHCQ99643 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHCQ99643 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHCQ99643 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHCQ99643 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHCQ99643 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHCQ99643 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHCQ99643 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHCQ99643 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHCQ99643 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHCQ99643 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHCQ99643 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHCQ99643 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHCQ99643 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHCQ99643 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDHCQ99643 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDHCQ99643 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHCQ99643 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDHCQ99643 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHCQ99643 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHCQ99643 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHCQ99643 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHCQ99643 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHCQ99643 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHCQ99643 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHCQ99643 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHCQ99643 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHCQ99643 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHCQ99643 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHCQ99643 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHCQ99643 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHCQ99643 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHCQ99643 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHCQ99643 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHCQ99643 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHCQ99643 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHCQ99643 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHCQ99643 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHCQ99643 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHCQ99643 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHCQ99643 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHCQ99643 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHCQ99643 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHCQ99643 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHCQ99643 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHCQ99643 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHCQ99643 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHCQ99643 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHCQ99643 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHCQ99643 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHCQ99643 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHCQ99643 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHCQ99643 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHCQ99643 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHCQ99643 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHCQ99643 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHCQ99643 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHCQ99643 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHCQ99643 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHCQ99643 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHCQ99643 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHCQ99643 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHCQ99643 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHCQ99643 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHCQ99643 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHCQ99643 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SDHCQ99643 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SDHCQ99643 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SDHCQ99643 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHCQ99643 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms