Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC1Q99614 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTC1Q99614 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTC1Q99614 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC1Q99614 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC1Q99614 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC1Q99614 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC1Q99614 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC1Q99614 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC1Q99614 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC1Q99614 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTC1Q99614 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTC1Q99614 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTC1Q99614 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TTC1Q99614 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TTC1Q99614 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC1Q99614 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTC1Q99614 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC1Q99614 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC1Q99614 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC1Q99614 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC1Q99614 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC1Q99614 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC1Q99614 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC1Q99614 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC1Q99614 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC1Q99614 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC1Q99614 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC1Q99614 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC1Q99614 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC1Q99614 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC1Q99614 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC1Q99614 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC1Q99614 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC1Q99614 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC1Q99614 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC1Q99614 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC1Q99614 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms