Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY1Q96T51 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY1Q96T51 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUFY1Q96T51 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY1Q96T51 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY1Q96T51 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUFY1Q96T51 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY1Q96T51 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY1Q96T51 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY1Q96T51 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY1Q96T51 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUFY1Q96T51 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUFY1Q96T51 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUFY1Q96T51 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUFY1Q96T51 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY1Q96T51 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY1Q96T51 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUFY1Q96T51 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY1Q96T51 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY1Q96T51 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUFY1Q96T51 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY1Q96T51 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY1Q96T51 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY1Q96T51 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RUFY1Q96T51 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RUFY1Q96T51 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY1Q96T51 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY1Q96T51 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY1Q96T51 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUFY1Q96T51 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY1Q96T51 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY1Q96T51 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY1Q96T51 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY1Q96T51 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RUFY1Q96T51 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY1Q96T51 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY1Q96T51 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY1Q96T51 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RUFY1Q96T51 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY1Q96T51 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY1Q96T51 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUFY1Q96T51 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUFY1Q96T51 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUFY1Q96T51 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUFY1Q96T51 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUFY1Q96T51 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY1Q96T51 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY1Q96T51 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY1Q96T51 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RUFY1Q96T51 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUFY1Q96T51 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY1Q96T51 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUFY1Q96T51 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY1Q96T51 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY1Q96T51 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY1Q96T51 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUFY1Q96T51 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY1Q96T51 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUFY1Q96T51 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY1Q96T51 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY1Q96T51 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUFY1Q96T51 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY1Q96T51 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUFY1Q96T51 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RUFY1Q96T51 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUFY1Q96T51 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUFY1Q96T51 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUFY1Q96T51 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY1Q96T51 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY1Q96T51 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY1Q96T51 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY1Q96T51 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUFY1Q96T51 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUFY1Q96T51 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RUFY1Q96T51 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY1Q96T51 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RUFY1Q96T51 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUFY1Q96T51 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUFY1Q96T51 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUFY1Q96T51 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUFY1Q96T51 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms