Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX18Q96RF0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX18Q96RF0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX18Q96RF0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX18Q96RF0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX18Q96RF0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX18Q96RF0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX18Q96RF0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX18Q96RF0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX18Q96RF0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX18Q96RF0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX18Q96RF0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX18Q96RF0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX18Q96RF0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX18Q96RF0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX18Q96RF0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX18Q96RF0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX18Q96RF0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX18Q96RF0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX18Q96RF0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX18Q96RF0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX18Q96RF0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX18Q96RF0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX18Q96RF0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX18Q96RF0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX18Q96RF0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.9 ms