Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4LQ96PU5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD4LQ96PU5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4LQ96PU5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD4LQ96PU5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4LQ96PU5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4LQ96PU5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4LQ96PU5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4LQ96PU5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD4LQ96PU5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD4LQ96PU5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD4LQ96PU5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4LQ96PU5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4LQ96PU5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4LQ96PU5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD4LQ96PU5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4LQ96PU5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD4LQ96PU5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4LQ96PU5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD4LQ96PU5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4LQ96PU5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD4LQ96PU5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD4LQ96PU5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD4LQ96PU5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD4LQ96PU5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4LQ96PU5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4LQ96PU5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4LQ96PU5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4LQ96PU5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD4LQ96PU5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD4LQ96PU5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4LQ96PU5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4LQ96PU5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4LQ96PU5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD4LQ96PU5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD4LQ96PU5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD4LQ96PU5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD4LQ96PU5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD4LQ96PU5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4LQ96PU5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4LQ96PU5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4LQ96PU5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD4LQ96PU5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD4LQ96PU5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD4LQ96PU5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4LQ96PU5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4LQ96PU5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4LQ96PU5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4LQ96PU5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4LQ96PU5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD4LQ96PU5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD4LQ96PU5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4LQ96PU5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4LQ96PU5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4LQ96PU5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4LQ96PU5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD4LQ96PU5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4LQ96PU5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms