Protein–RNA interactions for Protein: Q96PI1

SPRR4, Small proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR4Q96PI1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPRR4Q96PI1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRR4Q96PI1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms