Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DCHS1Q96JQ0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DCHS1Q96JQ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
DCHS1Q96JQ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DCHS1Q96JQ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCHS1Q96JQ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DCHS1Q96JQ0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DCHS1Q96JQ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DCHS1Q96JQ0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCHS1Q96JQ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DCHS1Q96JQ0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCHS1Q96JQ0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DCHS1Q96JQ0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DCHS1Q96JQ0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DCHS1Q96JQ0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCHS1Q96JQ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCHS1Q96JQ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCHS1Q96JQ0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCHS1Q96JQ0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCHS1Q96JQ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DCHS1Q96JQ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCHS1Q96JQ0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCHS1Q96JQ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCHS1Q96JQ0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCHS1Q96JQ0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCHS1Q96JQ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCHS1Q96JQ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCHS1Q96JQ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DCHS1Q96JQ0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DCHS1Q96JQ0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCHS1Q96JQ0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCHS1Q96JQ0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCHS1Q96JQ0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCHS1Q96JQ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCHS1Q96JQ0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCHS1Q96JQ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCHS1Q96JQ0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCHS1Q96JQ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCHS1Q96JQ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCHS1Q96JQ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCHS1Q96JQ0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCHS1Q96JQ0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCHS1Q96JQ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCHS1Q96JQ0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCHS1Q96JQ0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCHS1Q96JQ0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCHS1Q96JQ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCHS1Q96JQ0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DCHS1Q96JQ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCHS1Q96JQ0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DCHS1Q96JQ0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCHS1Q96JQ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCHS1Q96JQ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DCHS1Q96JQ0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DCHS1Q96JQ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCHS1Q96JQ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCHS1Q96JQ0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCHS1Q96JQ0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCHS1Q96JQ0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1212.8 ms