Protein–RNA interactions for Protein: Q96HR3

MED30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED30Q96HR3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED30Q96HR3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MED30Q96HR3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MED30Q96HR3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED30Q96HR3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED30Q96HR3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms