Protein–RNA interactions for Protein: Q96HB5

CCDC120, Coiled-coil domain-containing protein 120, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC120Q96HB5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC120Q96HB5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC120Q96HB5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC120Q96HB5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC120Q96HB5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC120Q96HB5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC120Q96HB5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC120Q96HB5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC120Q96HB5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC120Q96HB5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC120Q96HB5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC120Q96HB5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC120Q96HB5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC120Q96HB5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC120Q96HB5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC120Q96HB5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC120Q96HB5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC120Q96HB5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC120Q96HB5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC120Q96HB5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC120Q96HB5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC120Q96HB5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC120Q96HB5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC120Q96HB5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms