Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL29Q96CT2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL29Q96CT2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL29Q96CT2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL29Q96CT2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL29Q96CT2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL29Q96CT2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL29Q96CT2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL29Q96CT2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL29Q96CT2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL29Q96CT2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL29Q96CT2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL29Q96CT2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL29Q96CT2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL29Q96CT2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL29Q96CT2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL29Q96CT2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL29Q96CT2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL29Q96CT2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL29Q96CT2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL29Q96CT2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL29Q96CT2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL29Q96CT2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL29Q96CT2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL29Q96CT2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL29Q96CT2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL29Q96CT2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL29Q96CT2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL29Q96CT2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL29Q96CT2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL29Q96CT2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL29Q96CT2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL29Q96CT2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL29Q96CT2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL29Q96CT2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL29Q96CT2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL29Q96CT2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL29Q96CT2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL29Q96CT2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL29Q96CT2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL29Q96CT2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL29Q96CT2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL29Q96CT2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL29Q96CT2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL29Q96CT2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL29Q96CT2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL29Q96CT2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL29Q96CT2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL29Q96CT2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL29Q96CT2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL29Q96CT2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL29Q96CT2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL29Q96CT2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL29Q96CT2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL29Q96CT2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL29Q96CT2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL29Q96CT2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL29Q96CT2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL29Q96CT2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL29Q96CT2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL29Q96CT2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL29Q96CT2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL29Q96CT2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL29Q96CT2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL29Q96CT2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL29Q96CT2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL29Q96CT2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL29Q96CT2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms