Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN5

LRRC45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC45Q96CN5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC45Q96CN5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC45Q96CN5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC45Q96CN5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC45Q96CN5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC45Q96CN5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC45Q96CN5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC45Q96CN5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC45Q96CN5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC45Q96CN5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC45Q96CN5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC45Q96CN5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC45Q96CN5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC45Q96CN5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC45Q96CN5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC45Q96CN5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC45Q96CN5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC45Q96CN5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC45Q96CN5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC45Q96CN5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC45Q96CN5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC45Q96CN5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC45Q96CN5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC45Q96CN5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC45Q96CN5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC45Q96CN5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC45Q96CN5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC45Q96CN5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC45Q96CN5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRRC45Q96CN5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC45Q96CN5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC45Q96CN5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC45Q96CN5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC45Q96CN5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC45Q96CN5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC45Q96CN5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC45Q96CN5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC45Q96CN5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC45Q96CN5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC45Q96CN5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC45Q96CN5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC45Q96CN5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC45Q96CN5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC45Q96CN5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC45Q96CN5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC45Q96CN5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC45Q96CN5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC45Q96CN5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC45Q96CN5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC45Q96CN5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC45Q96CN5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC45Q96CN5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC45Q96CN5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC45Q96CN5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC45Q96CN5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC45Q96CN5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC45Q96CN5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC45Q96CN5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC45Q96CN5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC45Q96CN5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC45Q96CN5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC45Q96CN5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC45Q96CN5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC45Q96CN5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC45Q96CN5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC45Q96CN5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC45Q96CN5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC45Q96CN5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC45Q96CN5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC45Q96CN5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC45Q96CN5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC45Q96CN5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC45Q96CN5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC45Q96CN5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC45Q96CN5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC45Q96CN5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC45Q96CN5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC45Q96CN5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC45Q96CN5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC45Q96CN5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC45Q96CN5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC45Q96CN5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC45Q96CN5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC45Q96CN5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC45Q96CN5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC45Q96CN5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC45Q96CN5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC45Q96CN5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC45Q96CN5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC45Q96CN5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC45Q96CN5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC45Q96CN5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC45Q96CN5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC45Q96CN5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC45Q96CN5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC45Q96CN5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC45Q96CN5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC45Q96CN5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC45Q96CN5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC45Q96CN5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms