Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD5

PHF21A, PHD finger protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21AQ96BD5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHF21AQ96BD5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF21AQ96BD5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF21AQ96BD5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms