Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
CTTNBP2Q8WZ74 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CTTNBP2Q8WZ74 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CTTNBP2Q8WZ74 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CTTNBP2Q8WZ74 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
CTTNBP2Q8WZ74 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
CTTNBP2Q8WZ74 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CTTNBP2Q8WZ74 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CTTNBP2Q8WZ74 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CTTNBP2Q8WZ74 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CTTNBP2Q8WZ74 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
CTTNBP2Q8WZ74 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
CTTNBP2Q8WZ74 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CTTNBP2Q8WZ74 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CTTNBP2Q8WZ74 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
CTTNBP2Q8WZ74 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
CTTNBP2Q8WZ74 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
CTTNBP2Q8WZ74 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
CTTNBP2Q8WZ74 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
CTTNBP2Q8WZ74 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
CTTNBP2Q8WZ74 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CTTNBP2Q8WZ74 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CTTNBP2Q8WZ74 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
CTTNBP2Q8WZ74 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
CTTNBP2Q8WZ74 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
CTTNBP2Q8WZ74 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
CTTNBP2Q8WZ74 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
CTTNBP2Q8WZ74 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
CTTNBP2Q8WZ74 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CTTNBP2Q8WZ74 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
CTTNBP2Q8WZ74 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CTTNBP2Q8WZ74 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
CTTNBP2Q8WZ74 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
CTTNBP2Q8WZ74 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CTTNBP2Q8WZ74 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CTTNBP2Q8WZ74 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
CTTNBP2Q8WZ74 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC42.67■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.42
CTTNBP2Q8WZ74 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
CTTNBP2Q8WZ74 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CTTNBP2Q8WZ74 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CTTNBP2Q8WZ74 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CTTNBP2Q8WZ74 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CTTNBP2Q8WZ74 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
CTTNBP2Q8WZ74 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CTTNBP2Q8WZ74 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
CTTNBP2Q8WZ74 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
CTTNBP2Q8WZ74 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
CTTNBP2Q8WZ74 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.4
CTTNBP2Q8WZ74 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CTTNBP2Q8WZ74 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CTTNBP2Q8WZ74 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CTTNBP2Q8WZ74 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CTTNBP2Q8WZ74 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CTTNBP2Q8WZ74 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
CTTNBP2Q8WZ74 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
CTTNBP2Q8WZ74 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
CTTNBP2Q8WZ74 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CTTNBP2Q8WZ74 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms