Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKA2Q8WVK7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKA2Q8WVK7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKA2Q8WVK7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKA2Q8WVK7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKA2Q8WVK7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKA2Q8WVK7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKA2Q8WVK7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKA2Q8WVK7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKA2Q8WVK7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SKA2Q8WVK7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKA2Q8WVK7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKA2Q8WVK7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SKA2Q8WVK7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKA2Q8WVK7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKA2Q8WVK7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKA2Q8WVK7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKA2Q8WVK7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKA2Q8WVK7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKA2Q8WVK7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKA2Q8WVK7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKA2Q8WVK7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKA2Q8WVK7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKA2Q8WVK7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKA2Q8WVK7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKA2Q8WVK7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKA2Q8WVK7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKA2Q8WVK7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKA2Q8WVK7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKA2Q8WVK7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SKA2Q8WVK7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SKA2Q8WVK7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKA2Q8WVK7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKA2Q8WVK7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKA2Q8WVK7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKA2Q8WVK7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKA2Q8WVK7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKA2Q8WVK7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKA2Q8WVK7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKA2Q8WVK7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKA2Q8WVK7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SKA2Q8WVK7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKA2Q8WVK7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SKA2Q8WVK7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKA2Q8WVK7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKA2Q8WVK7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKA2Q8WVK7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKA2Q8WVK7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKA2Q8WVK7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKA2Q8WVK7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKA2Q8WVK7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SKA2Q8WVK7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKA2Q8WVK7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKA2Q8WVK7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SKA2Q8WVK7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms