Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYRIPQ8NFW9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYRIPQ8NFW9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYRIPQ8NFW9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYRIPQ8NFW9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYRIPQ8NFW9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYRIPQ8NFW9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYRIPQ8NFW9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYRIPQ8NFW9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYRIPQ8NFW9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MYRIPQ8NFW9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYRIPQ8NFW9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYRIPQ8NFW9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYRIPQ8NFW9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYRIPQ8NFW9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYRIPQ8NFW9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYRIPQ8NFW9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYRIPQ8NFW9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYRIPQ8NFW9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYRIPQ8NFW9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYRIPQ8NFW9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYRIPQ8NFW9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYRIPQ8NFW9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYRIPQ8NFW9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYRIPQ8NFW9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYRIPQ8NFW9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYRIPQ8NFW9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYRIPQ8NFW9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYRIPQ8NFW9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYRIPQ8NFW9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MYRIPQ8NFW9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYRIPQ8NFW9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYRIPQ8NFW9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYRIPQ8NFW9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYRIPQ8NFW9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYRIPQ8NFW9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYRIPQ8NFW9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYRIPQ8NFW9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYRIPQ8NFW9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYRIPQ8NFW9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYRIPQ8NFW9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYRIPQ8NFW9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYRIPQ8NFW9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYRIPQ8NFW9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYRIPQ8NFW9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYRIPQ8NFW9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYRIPQ8NFW9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MYRIPQ8NFW9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYRIPQ8NFW9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MYRIPQ8NFW9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYRIPQ8NFW9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYRIPQ8NFW9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYRIPQ8NFW9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYRIPQ8NFW9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYRIPQ8NFW9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYRIPQ8NFW9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYRIPQ8NFW9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYRIPQ8NFW9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYRIPQ8NFW9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYRIPQ8NFW9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYRIPQ8NFW9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYRIPQ8NFW9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYRIPQ8NFW9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYRIPQ8NFW9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYRIPQ8NFW9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYRIPQ8NFW9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYRIPQ8NFW9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MYRIPQ8NFW9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYRIPQ8NFW9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYRIPQ8NFW9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYRIPQ8NFW9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYRIPQ8NFW9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYRIPQ8NFW9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYRIPQ8NFW9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYRIPQ8NFW9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYRIPQ8NFW9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYRIPQ8NFW9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYRIPQ8NFW9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYRIPQ8NFW9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYRIPQ8NFW9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYRIPQ8NFW9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYRIPQ8NFW9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYRIPQ8NFW9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYRIPQ8NFW9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYRIPQ8NFW9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYRIPQ8NFW9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYRIPQ8NFW9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYRIPQ8NFW9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYRIPQ8NFW9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYRIPQ8NFW9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYRIPQ8NFW9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYRIPQ8NFW9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYRIPQ8NFW9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYRIPQ8NFW9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYRIPQ8NFW9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYRIPQ8NFW9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYRIPQ8NFW9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYRIPQ8NFW9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYRIPQ8NFW9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms