Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACBD4Q8NC06 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACBD4Q8NC06 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACBD4Q8NC06 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACBD4Q8NC06 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACBD4Q8NC06 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACBD4Q8NC06 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACBD4Q8NC06 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACBD4Q8NC06 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACBD4Q8NC06 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACBD4Q8NC06 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACBD4Q8NC06 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACBD4Q8NC06 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACBD4Q8NC06 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACBD4Q8NC06 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACBD4Q8NC06 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACBD4Q8NC06 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACBD4Q8NC06 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACBD4Q8NC06 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACBD4Q8NC06 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACBD4Q8NC06 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACBD4Q8NC06 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACBD4Q8NC06 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACBD4Q8NC06 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms