Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC18Q8N456 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC18Q8N456 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC18Q8N456 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC18Q8N456 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC18Q8N456 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC18Q8N456 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC18Q8N456 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC18Q8N456 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC18Q8N456 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC18Q8N456 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC18Q8N456 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC18Q8N456 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC18Q8N456 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC18Q8N456 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC18Q8N456 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC18Q8N456 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC18Q8N456 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC18Q8N456 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC18Q8N456 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC18Q8N456 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC18Q8N456 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC18Q8N456 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC18Q8N456 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC18Q8N456 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC18Q8N456 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC18Q8N456 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC18Q8N456 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC18Q8N456 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC18Q8N456 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC18Q8N456 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC18Q8N456 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC18Q8N456 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC18Q8N456 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC18Q8N456 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC18Q8N456 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC18Q8N456 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC18Q8N456 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC18Q8N456 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC18Q8N456 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC18Q8N456 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC18Q8N456 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC18Q8N456 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC18Q8N456 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC18Q8N456 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC18Q8N456 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC18Q8N456 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC18Q8N456 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC18Q8N456 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC18Q8N456 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC18Q8N456 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC18Q8N456 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC18Q8N456 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC18Q8N456 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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