Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA2D3Q8IZS8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA2D3Q8IZS8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA2D3Q8IZS8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA2D3Q8IZS8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA2D3Q8IZS8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA2D3Q8IZS8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA2D3Q8IZS8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA2D3Q8IZS8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA2D3Q8IZS8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA2D3Q8IZS8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA2D3Q8IZS8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA2D3Q8IZS8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA2D3Q8IZS8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA2D3Q8IZS8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACNA2D3Q8IZS8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CACNA2D3Q8IZS8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNA2D3Q8IZS8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA2D3Q8IZS8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA2D3Q8IZS8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA2D3Q8IZS8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA2D3Q8IZS8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA2D3Q8IZS8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA2D3Q8IZS8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA2D3Q8IZS8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA2D3Q8IZS8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA2D3Q8IZS8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CACNA2D3Q8IZS8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA2D3Q8IZS8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA2D3Q8IZS8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA2D3Q8IZS8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D3Q8IZS8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CACNA2D3Q8IZS8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA2D3Q8IZS8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CACNA2D3Q8IZS8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CACNA2D3Q8IZS8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D3Q8IZS8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D3Q8IZS8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D3Q8IZS8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA2D3Q8IZS8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA2D3Q8IZS8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA2D3Q8IZS8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA2D3Q8IZS8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA2D3Q8IZS8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA2D3Q8IZS8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA2D3Q8IZS8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA2D3Q8IZS8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA2D3Q8IZS8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA2D3Q8IZS8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA2D3Q8IZS8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA2D3Q8IZS8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA2D3Q8IZS8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA2D3Q8IZS8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA2D3Q8IZS8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA2D3Q8IZS8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA2D3Q8IZS8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA2D3Q8IZS8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA2D3Q8IZS8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA2D3Q8IZS8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA2D3Q8IZS8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D3Q8IZS8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D3Q8IZS8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA2D3Q8IZS8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA2D3Q8IZS8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA2D3Q8IZS8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA2D3Q8IZS8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA2D3Q8IZS8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA2D3Q8IZS8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA2D3Q8IZS8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CACNA2D3Q8IZS8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA2D3Q8IZS8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA2D3Q8IZS8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA2D3Q8IZS8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA2D3Q8IZS8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA2D3Q8IZS8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA2D3Q8IZS8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA2D3Q8IZS8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA2D3Q8IZS8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms