Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NELFCDQ8IXH7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NELFCDQ8IXH7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NELFCDQ8IXH7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NELFCDQ8IXH7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NELFCDQ8IXH7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NELFCDQ8IXH7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NELFCDQ8IXH7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NELFCDQ8IXH7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NELFCDQ8IXH7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NELFCDQ8IXH7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NELFCDQ8IXH7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NELFCDQ8IXH7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NELFCDQ8IXH7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NELFCDQ8IXH7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NELFCDQ8IXH7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NELFCDQ8IXH7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NELFCDQ8IXH7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NELFCDQ8IXH7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NELFCDQ8IXH7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NELFCDQ8IXH7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NELFCDQ8IXH7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NELFCDQ8IXH7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NELFCDQ8IXH7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NELFCDQ8IXH7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NELFCDQ8IXH7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NELFCDQ8IXH7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NELFCDQ8IXH7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NELFCDQ8IXH7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NELFCDQ8IXH7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NELFCDQ8IXH7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NELFCDQ8IXH7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NELFCDQ8IXH7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NELFCDQ8IXH7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NELFCDQ8IXH7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NELFCDQ8IXH7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NELFCDQ8IXH7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NELFCDQ8IXH7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NELFCDQ8IXH7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NELFCDQ8IXH7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NELFCDQ8IXH7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NELFCDQ8IXH7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NELFCDQ8IXH7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NELFCDQ8IXH7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NELFCDQ8IXH7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NELFCDQ8IXH7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NELFCDQ8IXH7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NELFCDQ8IXH7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NELFCDQ8IXH7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NELFCDQ8IXH7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NELFCDQ8IXH7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NELFCDQ8IXH7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NELFCDQ8IXH7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NELFCDQ8IXH7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NELFCDQ8IXH7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NELFCDQ8IXH7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NELFCDQ8IXH7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NELFCDQ8IXH7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NELFCDQ8IXH7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NELFCDQ8IXH7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NELFCDQ8IXH7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NELFCDQ8IXH7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NELFCDQ8IXH7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NELFCDQ8IXH7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NELFCDQ8IXH7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NELFCDQ8IXH7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NELFCDQ8IXH7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NELFCDQ8IXH7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NELFCDQ8IXH7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NELFCDQ8IXH7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NELFCDQ8IXH7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NELFCDQ8IXH7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NELFCDQ8IXH7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NELFCDQ8IXH7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NELFCDQ8IXH7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NELFCDQ8IXH7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NELFCDQ8IXH7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms