Protein–RNA interactions for Protein: Q86YJ5

MARCH9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH9Q86YJ5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCH9Q86YJ5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCH9Q86YJ5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH9Q86YJ5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH9Q86YJ5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH9Q86YJ5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH9Q86YJ5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH9Q86YJ5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH9Q86YJ5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH9Q86YJ5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH9Q86YJ5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH9Q86YJ5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH9Q86YJ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH9Q86YJ5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH9Q86YJ5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH9Q86YJ5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH9Q86YJ5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
MARCH9Q86YJ5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH9Q86YJ5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH9Q86YJ5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCH9Q86YJ5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MARCH9Q86YJ5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH9Q86YJ5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MARCH9Q86YJ5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH9Q86YJ5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH9Q86YJ5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH9Q86YJ5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH9Q86YJ5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MARCH9Q86YJ5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH9Q86YJ5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH9Q86YJ5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH9Q86YJ5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH9Q86YJ5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH9Q86YJ5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCH9Q86YJ5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH9Q86YJ5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCH9Q86YJ5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCH9Q86YJ5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCH9Q86YJ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCH9Q86YJ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH9Q86YJ5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCH9Q86YJ5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCH9Q86YJ5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MARCH9Q86YJ5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH9Q86YJ5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH9Q86YJ5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MARCH9Q86YJ5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1139.7 ms