Protein–RNA interactions for Protein: Q86X83

COMMD2, COMM domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD2Q86X83 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD2Q86X83 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD2Q86X83 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD2Q86X83 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD2Q86X83 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD2Q86X83 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COMMD2Q86X83 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COMMD2Q86X83 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD2Q86X83 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COMMD2Q86X83 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD2Q86X83 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD2Q86X83 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD2Q86X83 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COMMD2Q86X83 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD2Q86X83 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD2Q86X83 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COMMD2Q86X83 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COMMD2Q86X83 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD2Q86X83 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COMMD2Q86X83 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COMMD2Q86X83 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COMMD2Q86X83 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD2Q86X83 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD2Q86X83 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD2Q86X83 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD2Q86X83 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD2Q86X83 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD2Q86X83 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD2Q86X83 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD2Q86X83 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD2Q86X83 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms