Protein–RNA interactions for Protein: Q86T20

SMIM29, Uncharacterized protein SMIM29, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM29Q86T20 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM29Q86T20 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM29Q86T20 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM29Q86T20 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM29Q86T20 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM29Q86T20 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM29Q86T20 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM29Q86T20 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM29Q86T20 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM29Q86T20 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM29Q86T20 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM29Q86T20 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM29Q86T20 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM29Q86T20 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM29Q86T20 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM29Q86T20 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM29Q86T20 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM29Q86T20 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM29Q86T20 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM29Q86T20 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM29Q86T20 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM29Q86T20 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM29Q86T20 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM29Q86T20 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM29Q86T20 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM29Q86T20 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM29Q86T20 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM29Q86T20 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM29Q86T20 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM29Q86T20 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM29Q86T20 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM29Q86T20 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM29Q86T20 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM29Q86T20 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM29Q86T20 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM29Q86T20 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms