Protein–RNA interactions for Protein: Q76KD6

SPATC1, Speriolin, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATC1Q76KD6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATC1Q76KD6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATC1Q76KD6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATC1Q76KD6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATC1Q76KD6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATC1Q76KD6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATC1Q76KD6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATC1Q76KD6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATC1Q76KD6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPATC1Q76KD6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATC1Q76KD6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATC1Q76KD6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATC1Q76KD6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATC1Q76KD6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATC1Q76KD6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATC1Q76KD6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATC1Q76KD6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPATC1Q76KD6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATC1Q76KD6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATC1Q76KD6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATC1Q76KD6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATC1Q76KD6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATC1Q76KD6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPATC1Q76KD6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPATC1Q76KD6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPATC1Q76KD6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPATC1Q76KD6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPATC1Q76KD6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATC1Q76KD6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATC1Q76KD6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms