Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCSAPQ6IQ19 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCSAPQ6IQ19 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCSAPQ6IQ19 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCSAPQ6IQ19 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCSAPQ6IQ19 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCSAPQ6IQ19 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCSAPQ6IQ19 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCSAPQ6IQ19 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCSAPQ6IQ19 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCSAPQ6IQ19 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCSAPQ6IQ19 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCSAPQ6IQ19 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCSAPQ6IQ19 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCSAPQ6IQ19 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
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