Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMYD5Q6GMV2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMYD5Q6GMV2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMYD5Q6GMV2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMYD5Q6GMV2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMYD5Q6GMV2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMYD5Q6GMV2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMYD5Q6GMV2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMYD5Q6GMV2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMYD5Q6GMV2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMYD5Q6GMV2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMYD5Q6GMV2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SMYD5Q6GMV2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMYD5Q6GMV2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMYD5Q6GMV2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMYD5Q6GMV2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMYD5Q6GMV2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMYD5Q6GMV2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMYD5Q6GMV2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMYD5Q6GMV2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMYD5Q6GMV2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMYD5Q6GMV2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMYD5Q6GMV2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMYD5Q6GMV2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMYD5Q6GMV2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMYD5Q6GMV2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SMYD5Q6GMV2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMYD5Q6GMV2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMYD5Q6GMV2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMYD5Q6GMV2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMYD5Q6GMV2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SMYD5Q6GMV2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SMYD5Q6GMV2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMYD5Q6GMV2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMYD5Q6GMV2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMYD5Q6GMV2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMYD5Q6GMV2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMYD5Q6GMV2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMYD5Q6GMV2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMYD5Q6GMV2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMYD5Q6GMV2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMYD5Q6GMV2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMYD5Q6GMV2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMYD5Q6GMV2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMYD5Q6GMV2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMYD5Q6GMV2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMYD5Q6GMV2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMYD5Q6GMV2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMYD5Q6GMV2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SMYD5Q6GMV2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMYD5Q6GMV2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMYD5Q6GMV2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMYD5Q6GMV2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMYD5Q6GMV2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMYD5Q6GMV2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMYD5Q6GMV2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMYD5Q6GMV2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMYD5Q6GMV2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMYD5Q6GMV2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMYD5Q6GMV2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMYD5Q6GMV2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMYD5Q6GMV2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SMYD5Q6GMV2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMYD5Q6GMV2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMYD5Q6GMV2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMYD5Q6GMV2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMYD5Q6GMV2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMYD5Q6GMV2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMYD5Q6GMV2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMYD5Q6GMV2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMYD5Q6GMV2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMYD5Q6GMV2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SMYD5Q6GMV2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMYD5Q6GMV2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMYD5Q6GMV2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMYD5Q6GMV2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMYD5Q6GMV2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms