Protein–RNA interactions for Protein: Q6EKJ0

GTF2IRD2B, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IRD2BQ6EKJ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2IRD2BQ6EKJ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2IRD2BQ6EKJ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2IRD2BQ6EKJ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IRD2BQ6EKJ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IRD2BQ6EKJ0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IRD2BQ6EKJ0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2IRD2BQ6EKJ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms