Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG85

Putative UPF0633 protein LOC554249, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XG85 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q5XG85 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q5XG85 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q5XG85 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q5XG85 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q5XG85 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q5XG85 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q5XG85 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q5XG85 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q5XG85 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q5XG85 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q5XG85 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q5XG85 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q5XG85 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q5XG85 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q5XG85 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q5XG85 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q5XG85 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q5XG85 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q5XG85 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q5XG85 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q5XG85 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q5XG85 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q5XG85 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q5XG85 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q5XG85 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q5XG85 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q5XG85 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q5XG85 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q5XG85 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q5XG85 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q5XG85 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q5XG85 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q5XG85 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q5XG85 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q5XG85 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q5XG85 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q5XG85 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q5XG85 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q5XG85 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q5XG85 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q5XG85 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q5XG85 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q5XG85 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q5XG85 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q5XG85 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q5XG85 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q5XG85 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q5XG85 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q5XG85 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q5XG85 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q5XG85 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q5XG85 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q5XG85 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q5XG85 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q5XG85 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q5XG85 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q5XG85 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q5XG85 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q5XG85 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q5XG85 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q5XG85 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q5XG85 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q5XG85 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q5XG85 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q5XG85 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q5XG85 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q5XG85 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5XG85 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XG85 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XG85 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XG85 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5XG85 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5XG85 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5XG85 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5XG85 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q5XG85 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q5XG85 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q5XG85 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q5XG85 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q5XG85 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q5XG85 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q5XG85 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q5XG85 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q5XG85 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q5XG85 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q5XG85 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q5XG85 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q5XG85 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q5XG85 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q5XG85 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q5XG85 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q5XG85 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q5XG85 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q5XG85 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q5XG85 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q5XG85 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q5XG85 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q5XG85 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q5XG85 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms