Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM74A1Q5RGS3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM74A1Q5RGS3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM74A1Q5RGS3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM74A1Q5RGS3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM74A1Q5RGS3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM74A1Q5RGS3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM74A1Q5RGS3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM74A1Q5RGS3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM74A1Q5RGS3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM74A1Q5RGS3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM74A1Q5RGS3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM74A1Q5RGS3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM74A1Q5RGS3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM74A1Q5RGS3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM74A1Q5RGS3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM74A1Q5RGS3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM74A1Q5RGS3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM74A1Q5RGS3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM74A1Q5RGS3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM74A1Q5RGS3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM74A1Q5RGS3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM74A1Q5RGS3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM74A1Q5RGS3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM74A1Q5RGS3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM74A1Q5RGS3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM74A1Q5RGS3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM74A1Q5RGS3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM74A1Q5RGS3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM74A1Q5RGS3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM74A1Q5RGS3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM74A1Q5RGS3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM74A1Q5RGS3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM74A1Q5RGS3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms