Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9K0

TMEM44, Transmembrane protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM44Q2T9K0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM44Q2T9K0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM44Q2T9K0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM44Q2T9K0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM44Q2T9K0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM44Q2T9K0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM44Q2T9K0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM44Q2T9K0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM44Q2T9K0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM44Q2T9K0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM44Q2T9K0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM44Q2T9K0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM44Q2T9K0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM44Q2T9K0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM44Q2T9K0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM44Q2T9K0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM44Q2T9K0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM44Q2T9K0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM44Q2T9K0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM44Q2T9K0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM44Q2T9K0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM44Q2T9K0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM44Q2T9K0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM44Q2T9K0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM44Q2T9K0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM44Q2T9K0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM44Q2T9K0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM44Q2T9K0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM44Q2T9K0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM44Q2T9K0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM44Q2T9K0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM44Q2T9K0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM44Q2T9K0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM44Q2T9K0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM44Q2T9K0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM44Q2T9K0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM44Q2T9K0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM44Q2T9K0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM44Q2T9K0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.6 ms