Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODF4Q2M2E3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODF4Q2M2E3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODF4Q2M2E3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ODF4Q2M2E3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODF4Q2M2E3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODF4Q2M2E3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODF4Q2M2E3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODF4Q2M2E3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODF4Q2M2E3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODF4Q2M2E3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODF4Q2M2E3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF4Q2M2E3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF4Q2M2E3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF4Q2M2E3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF4Q2M2E3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF4Q2M2E3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF4Q2M2E3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF4Q2M2E3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF4Q2M2E3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF4Q2M2E3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ODF4Q2M2E3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ODF4Q2M2E3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF4Q2M2E3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF4Q2M2E3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF4Q2M2E3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF4Q2M2E3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF4Q2M2E3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF4Q2M2E3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ODF4Q2M2E3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ODF4Q2M2E3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ODF4Q2M2E3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODF4Q2M2E3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODF4Q2M2E3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODF4Q2M2E3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODF4Q2M2E3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ODF4Q2M2E3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODF4Q2M2E3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ODF4Q2M2E3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ODF4Q2M2E3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ODF4Q2M2E3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ODF4Q2M2E3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODF4Q2M2E3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ODF4Q2M2E3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODF4Q2M2E3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODF4Q2M2E3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODF4Q2M2E3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODF4Q2M2E3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODF4Q2M2E3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ODF4Q2M2E3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ODF4Q2M2E3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ODF4Q2M2E3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ODF4Q2M2E3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ODF4Q2M2E3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODF4Q2M2E3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODF4Q2M2E3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ODF4Q2M2E3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ODF4Q2M2E3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODF4Q2M2E3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODF4Q2M2E3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODF4Q2M2E3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ODF4Q2M2E3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ODF4Q2M2E3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ODF4Q2M2E3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ODF4Q2M2E3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ODF4Q2M2E3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ODF4Q2M2E3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ODF4Q2M2E3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF4Q2M2E3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF4Q2M2E3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF4Q2M2E3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF4Q2M2E3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ODF4Q2M2E3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ODF4Q2M2E3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ODF4Q2M2E3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ODF4Q2M2E3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ODF4Q2M2E3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ODF4Q2M2E3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ODF4Q2M2E3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ODF4Q2M2E3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms