Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
R3HDM1Q15032 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
R3HDM1Q15032 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
R3HDM1Q15032 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
R3HDM1Q15032 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
R3HDM1Q15032 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
R3HDM1Q15032 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
R3HDM1Q15032 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
R3HDM1Q15032 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
R3HDM1Q15032 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
R3HDM1Q15032 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
R3HDM1Q15032 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
R3HDM1Q15032 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
R3HDM1Q15032 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
R3HDM1Q15032 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
R3HDM1Q15032 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
R3HDM1Q15032 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
R3HDM1Q15032 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
R3HDM1Q15032 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
R3HDM1Q15032 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
R3HDM1Q15032 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
R3HDM1Q15032 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
R3HDM1Q15032 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
R3HDM1Q15032 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
R3HDM1Q15032 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
R3HDM1Q15032 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
R3HDM1Q15032 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
R3HDM1Q15032 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
R3HDM1Q15032 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
R3HDM1Q15032 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
R3HDM1Q15032 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
R3HDM1Q15032 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
R3HDM1Q15032 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
R3HDM1Q15032 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
R3HDM1Q15032 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
R3HDM1Q15032 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
R3HDM1Q15032 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
R3HDM1Q15032 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
R3HDM1Q15032 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
R3HDM1Q15032 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
R3HDM1Q15032 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
R3HDM1Q15032 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
R3HDM1Q15032 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
R3HDM1Q15032 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
R3HDM1Q15032 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
R3HDM1Q15032 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
R3HDM1Q15032 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
R3HDM1Q15032 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
R3HDM1Q15032 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
R3HDM1Q15032 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
R3HDM1Q15032 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
R3HDM1Q15032 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
R3HDM1Q15032 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
R3HDM1Q15032 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
R3HDM1Q15032 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
R3HDM1Q15032 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
R3HDM1Q15032 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
R3HDM1Q15032 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
R3HDM1Q15032 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
R3HDM1Q15032 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
R3HDM1Q15032 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
R3HDM1Q15032 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
R3HDM1Q15032 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
R3HDM1Q15032 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
R3HDM1Q15032 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
R3HDM1Q15032 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
R3HDM1Q15032 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
R3HDM1Q15032 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
R3HDM1Q15032 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
R3HDM1Q15032 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
R3HDM1Q15032 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
R3HDM1Q15032 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
R3HDM1Q15032 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
R3HDM1Q15032 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
R3HDM1Q15032 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
R3HDM1Q15032 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
R3HDM1Q15032 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
R3HDM1Q15032 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
R3HDM1Q15032 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
R3HDM1Q15032 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
R3HDM1Q15032 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
R3HDM1Q15032 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
R3HDM1Q15032 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
R3HDM1Q15032 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
R3HDM1Q15032 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
R3HDM1Q15032 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
R3HDM1Q15032 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
R3HDM1Q15032 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
R3HDM1Q15032 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
R3HDM1Q15032 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
R3HDM1Q15032 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
R3HDM1Q15032 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
R3HDM1Q15032 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
R3HDM1Q15032 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
R3HDM1Q15032 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
R3HDM1Q15032 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
R3HDM1Q15032 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
R3HDM1Q15032 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
R3HDM1Q15032 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
R3HDM1Q15032 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
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