Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPNMBQ14956 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GPNMBQ14956 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GPNMBQ14956 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GPNMBQ14956 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPNMBQ14956 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPNMBQ14956 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPNMBQ14956 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPNMBQ14956 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPNMBQ14956 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPNMBQ14956 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPNMBQ14956 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPNMBQ14956 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPNMBQ14956 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPNMBQ14956 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPNMBQ14956 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPNMBQ14956 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPNMBQ14956 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPNMBQ14956 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPNMBQ14956 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPNMBQ14956 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPNMBQ14956 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPNMBQ14956 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPNMBQ14956 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPNMBQ14956 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPNMBQ14956 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPNMBQ14956 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPNMBQ14956 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPNMBQ14956 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPNMBQ14956 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPNMBQ14956 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPNMBQ14956 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPNMBQ14956 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPNMBQ14956 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPNMBQ14956 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPNMBQ14956 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPNMBQ14956 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPNMBQ14956 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPNMBQ14956 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPNMBQ14956 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPNMBQ14956 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPNMBQ14956 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPNMBQ14956 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPNMBQ14956 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPNMBQ14956 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPNMBQ14956 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPNMBQ14956 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPNMBQ14956 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPNMBQ14956 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPNMBQ14956 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPNMBQ14956 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPNMBQ14956 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPNMBQ14956 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GPNMBQ14956 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPNMBQ14956 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPNMBQ14956 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPNMBQ14956 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GPNMBQ14956 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GPNMBQ14956 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
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