Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CUL3Q13618 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CUL3Q13618 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL3Q13618 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL3Q13618 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL3Q13618 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL3Q13618 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL3Q13618 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL3Q13618 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL3Q13618 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL3Q13618 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL3Q13618 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL3Q13618 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL3Q13618 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CUL3Q13618 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CUL3Q13618 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL3Q13618 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL3Q13618 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL3Q13618 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL3Q13618 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL3Q13618 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL3Q13618 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL3Q13618 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL3Q13618 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL3Q13618 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL3Q13618 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL3Q13618 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL3Q13618 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL3Q13618 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CUL3Q13618 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL3Q13618 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL3Q13618 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CUL3Q13618 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CUL3Q13618 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CUL3Q13618 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL3Q13618 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL3Q13618 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL3Q13618 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL3Q13618 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL3Q13618 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL3Q13618 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CUL3Q13618 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CUL3Q13618 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CUL3Q13618 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CUL3Q13618 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CUL3Q13618 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL3Q13618 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
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