Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 RPL17-C18orf32-202ENST00000577910 1012 ntTSL 56.87□□□□□ -1.313e-32■■■■■ 36.4
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TRA2AQ13595 RPL17-219ENST00000584364 523 ntTSL 24.12□□□□□ -1.753e-32■■■■■ 36.4
TRA2AQ13595 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.652e-11■■■■■ 36.3
TRA2AQ13595 PCNT-208ENST00000490468 1415 ntTSL 512.88□□□□□ -0.352e-11■■■■■ 36.3
TRA2AQ13595 PCNT-204ENST00000466474 895 ntTSL 311.14□□□□□ -0.632e-11■■■■■ 36.3
TRA2AQ13595 PCNT-207ENST00000483844 734 ntTSL 39.36□□□□□ -0.912e-11■■■■■ 36.3
TRA2AQ13595 PPP4R2-202ENST00000460360 572 ntTSL 45.68□□□□□ -1.52e-11■■■■■ 36.3
TRA2AQ13595 COL27A1-207ENST00000494090 5329 ntTSL 1 (best)17.34■□□□□ 0.373e-7■■■■■ 36
TRA2AQ13595 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 36
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TRA2AQ13595 SUPT5H-220ENST00000601978 538 ntTSL 213.41□□□□□ -0.265e-9■■■■■ 36
TRA2AQ13595 SUPT5H-206ENST00000594729 364 ntTSL 512.14□□□□□ -0.475e-9■■■■■ 36
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TRA2AQ13595 SUPT5H-213ENST00000598725 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.944e-8■■■■■ 36
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TRA2AQ13595 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.496e-10■■■■■ 35.9
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TRA2AQ13595 TRAF3IP1-203ENST00000409739 1070 ntTSL 330.43■■■□□ 2.464e-8■■■■■ 35.7
TRA2AQ13595 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.054e-8■■■■■ 35.7
TRA2AQ13595 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.034e-8■■■■■ 35.7
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TRA2AQ13595 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.92e-16■■■■■ 35.5
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TRA2AQ13595 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.775e-10■■■■■ 34.7
TRA2AQ13595 NUDCD3-204ENST00000464812 811 ntTSL 58.53□□□□□ -1.045e-10■■■■■ 34.7
TRA2AQ13595 NUDCD3-208ENST00000480209 488 ntTSL 38.53□□□□□ -1.045e-10■■■■■ 34.7
TRA2AQ13595 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 34.6
TRA2AQ13595 UPF3B-204ENST00000619445 1385 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 34.6
TRA2AQ13595 UPF3B-201ENST00000276201 2378 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 34.6
TRA2AQ13595 HNRNPM-209ENST00000597813 630 ntTSL 220.28■□□□□ 0.842e-11■■■■■ 34.6
TRA2AQ13595 RABL6-205ENST00000435930 3328 ntTSL 213.09□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 34.5
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TRA2AQ13595 LARP7-203ENST00000503316 278 ntTSL 31.69□□□□□ -2.148e-11■■■■■ 34.5
TRA2AQ13595 LUC7L3-203ENST00000503728 783 ntTSL 53.8□□□□□ -1.87e-11■■■■■ 34.4
TRA2AQ13595 LUC7L3-222ENST00000513969 419 ntTSL 31.45□□□□□ -2.187e-11■■■■■ 34.4
TRA2AQ13595 HNRNPM-203ENST00000593293 764 ntTSL 32.95□□□□□ -1.948e-11■■■■■ 34.3
TRA2AQ13595 LUC7L3-216ENST00000509487 647 ntTSL 33.2□□□□□ -1.94e-11■■■■■ 34.2
TRA2AQ13595 SLU7-207ENST00000521320 492 ntTSL 23.26□□□□□ -1.894e-9■■■■■ 34.1
TRA2AQ13595 GIGYF2-220ENST00000440945 2658 ntTSL 1 (best)8.14□□□□□ -1.119e-9■■■■■ 34
TRA2AQ13595 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.232e-7■■■■■ 34
TRA2AQ13595 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.472e-7■■■■■ 34
TRA2AQ13595 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 34
TRA2AQ13595 CCAR1-216ENST00000543706 869 ntTSL 54.69□□□□□ -1.662e-7■■■■■ 34
TRA2AQ13595 CCAR1-211ENST00000539539 3224 ntTSL 24.07□□□□□ -1.762e-7■■■■■ 34
TRA2AQ13595 CCAR1-212ENST00000540210 3415 ntTSL 1 (best)3.89□□□□□ -1.792e-7■■■■■ 34
TRA2AQ13595 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.052e-7■■■■■ 34
TRA2AQ13595 RABL6-210ENST00000484471 2746 ntTSL 516.95■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 34
TRA2AQ13595 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 02e-7■■■■■ 34
TRA2AQ13595 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 34
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