Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRN3Q13033 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
STRN3Q13033 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
STRN3Q13033 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
STRN3Q13033 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
STRN3Q13033 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRN3Q13033 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRN3Q13033 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRN3Q13033 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRN3Q13033 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRN3Q13033 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRN3Q13033 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRN3Q13033 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRN3Q13033 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRN3Q13033 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STRN3Q13033 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
STRN3Q13033 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
STRN3Q13033 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
STRN3Q13033 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRN3Q13033 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRN3Q13033 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
STRN3Q13033 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRN3Q13033 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRN3Q13033 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRN3Q13033 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRN3Q13033 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRN3Q13033 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRN3Q13033 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRN3Q13033 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRN3Q13033 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRN3Q13033 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRN3Q13033 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRN3Q13033 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRN3Q13033 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRN3Q13033 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRN3Q13033 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRN3Q13033 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRN3Q13033 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRN3Q13033 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRN3Q13033 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRN3Q13033 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRN3Q13033 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
STRN3Q13033 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRN3Q13033 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRN3Q13033 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRN3Q13033 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRN3Q13033 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRN3Q13033 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
STRN3Q13033 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRN3Q13033 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRN3Q13033 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRN3Q13033 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRN3Q13033 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRN3Q13033 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRN3Q13033 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRN3Q13033 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRN3Q13033 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRN3Q13033 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRN3Q13033 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRN3Q13033 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRN3Q13033 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRN3Q13033 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRN3Q13033 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRN3Q13033 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRN3Q13033 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRN3Q13033 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
STRN3Q13033 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRN3Q13033 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRN3Q13033 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRN3Q13033 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRN3Q13033 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRN3Q13033 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRN3Q13033 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRN3Q13033 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRN3Q13033 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRN3Q13033 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRN3Q13033 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRN3Q13033 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
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