Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BNIP1Q12981 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNIP1Q12981 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNIP1Q12981 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BNIP1Q12981 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BNIP1Q12981 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BNIP1Q12981 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BNIP1Q12981 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BNIP1Q12981 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BNIP1Q12981 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BNIP1Q12981 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BNIP1Q12981 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BNIP1Q12981 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BNIP1Q12981 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNIP1Q12981 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNIP1Q12981 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNIP1Q12981 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNIP1Q12981 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNIP1Q12981 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BNIP1Q12981 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BNIP1Q12981 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BNIP1Q12981 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BNIP1Q12981 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BNIP1Q12981 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BNIP1Q12981 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BNIP1Q12981 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BNIP1Q12981 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BNIP1Q12981 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BNIP1Q12981 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BNIP1Q12981 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNIP1Q12981 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNIP1Q12981 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNIP1Q12981 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNIP1Q12981 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BNIP1Q12981 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNIP1Q12981 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNIP1Q12981 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNIP1Q12981 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BNIP1Q12981 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BNIP1Q12981 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BNIP1Q12981 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BNIP1Q12981 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BNIP1Q12981 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BNIP1Q12981 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BNIP1Q12981 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BNIP1Q12981 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BNIP1Q12981 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BNIP1Q12981 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BNIP1Q12981 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BNIP1Q12981 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BNIP1Q12981 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BNIP1Q12981 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BNIP1Q12981 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BNIP1Q12981 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BNIP1Q12981 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BNIP1Q12981 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BNIP1Q12981 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BNIP1Q12981 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BNIP1Q12981 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BNIP1Q12981 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BNIP1Q12981 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BNIP1Q12981 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BNIP1Q12981 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BNIP1Q12981 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BNIP1Q12981 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BNIP1Q12981 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms