Protein–RNA interactions for Protein: Q12798

CETN1, Centrin-1, humanhuman

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETN1Q12798 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CETN1Q12798 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CETN1Q12798 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CETN1Q12798 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CETN1Q12798 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CETN1Q12798 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CETN1Q12798 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CETN1Q12798 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CETN1Q12798 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CETN1Q12798 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CETN1Q12798 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CETN1Q12798 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CETN1Q12798 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CETN1Q12798 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CETN1Q12798 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CETN1Q12798 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CETN1Q12798 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CETN1Q12798 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CETN1Q12798 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CETN1Q12798 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CETN1Q12798 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CETN1Q12798 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CETN1Q12798 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CETN1Q12798 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CETN1Q12798 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CETN1Q12798 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CETN1Q12798 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CETN1Q12798 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CETN1Q12798 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CETN1Q12798 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CETN1Q12798 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CETN1Q12798 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CETN1Q12798 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CETN1Q12798 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CETN1Q12798 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CETN1Q12798 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CETN1Q12798 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CETN1Q12798 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CETN1Q12798 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CETN1Q12798 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CETN1Q12798 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CETN1Q12798 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CETN1Q12798 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CETN1Q12798 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CETN1Q12798 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CETN1Q12798 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CETN1Q12798 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CETN1Q12798 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CETN1Q12798 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CETN1Q12798 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CETN1Q12798 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CETN1Q12798 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CETN1Q12798 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CETN1Q12798 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CETN1Q12798 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CETN1Q12798 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CETN1Q12798 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CETN1Q12798 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CETN1Q12798 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CETN1Q12798 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CETN1Q12798 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CETN1Q12798 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CETN1Q12798 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CETN1Q12798 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CETN1Q12798 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CETN1Q12798 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CETN1Q12798 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CETN1Q12798 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CETN1Q12798 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CETN1Q12798 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CETN1Q12798 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CETN1Q12798 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CETN1Q12798 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CETN1Q12798 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CETN1Q12798 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CETN1Q12798 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CETN1Q12798 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CETN1Q12798 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CETN1Q12798 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CETN1Q12798 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CETN1Q12798 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CETN1Q12798 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CETN1Q12798 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CETN1Q12798 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CETN1Q12798 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CETN1Q12798 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CETN1Q12798 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CETN1Q12798 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CETN1Q12798 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CETN1Q12798 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CETN1Q12798 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CETN1Q12798 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CETN1Q12798 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CETN1Q12798 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CETN1Q12798 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CETN1Q12798 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CETN1Q12798 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CETN1Q12798 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CETN1Q12798 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CETN1Q12798 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms