Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXO1Q12778 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO1Q12778 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO1Q12778 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO1Q12778 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO1Q12778 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO1Q12778 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO1Q12778 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO1Q12778 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO1Q12778 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXO1Q12778 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO1Q12778 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO1Q12778 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO1Q12778 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO1Q12778 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FOXO1Q12778 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXO1Q12778 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FOXO1Q12778 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FOXO1Q12778 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXO1Q12778 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXO1Q12778 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXO1Q12778 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FOXO1Q12778 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXO1Q12778 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXO1Q12778 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXO1Q12778 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXO1Q12778 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO1Q12778 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO1Q12778 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO1Q12778 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXO1Q12778 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXO1Q12778 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXO1Q12778 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXO1Q12778 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXO1Q12778 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXO1Q12778 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXO1Q12778 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXO1Q12778 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXO1Q12778 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXO1Q12778 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO1Q12778 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO1Q12778 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXO1Q12778 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO1Q12778 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXO1Q12778 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXO1Q12778 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXO1Q12778 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXO1Q12778 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO1Q12778 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO1Q12778 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO1Q12778 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO1Q12778 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO1Q12778 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO1Q12778 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO1Q12778 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXO1Q12778 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXO1Q12778 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXO1Q12778 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXO1Q12778 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXO1Q12778 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXO1Q12778 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXO1Q12778 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXO1Q12778 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXO1Q12778 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXO1Q12778 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXO1Q12778 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOXO1Q12778 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXO1Q12778 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXO1Q12778 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXO1Q12778 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXO1Q12778 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXO1Q12778 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXO1Q12778 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXO1Q12778 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXO1Q12778 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXO1Q12778 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXO1Q12778 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXO1Q12778 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms