Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
FOXO1Q12778 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FOXO1Q12778 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOXO1Q12778 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FOXO1Q12778 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FOXO1Q12778 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOXO1Q12778 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
FOXO1Q12778 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FOXO1Q12778 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FOXO1Q12778 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXO1Q12778 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXO1Q12778 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXO1Q12778 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXO1Q12778 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXO1Q12778 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXO1Q12778 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOXO1Q12778 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXO1Q12778 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXO1Q12778 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXO1Q12778 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXO1Q12778 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOXO1Q12778 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOXO1Q12778 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXO1Q12778 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXO1Q12778 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXO1Q12778 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXO1Q12778 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXO1Q12778 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXO1Q12778 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXO1Q12778 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXO1Q12778 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXO1Q12778 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXO1Q12778 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXO1Q12778 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXO1Q12778 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXO1Q12778 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXO1Q12778 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXO1Q12778 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXO1Q12778 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXO1Q12778 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXO1Q12778 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXO1Q12778 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXO1Q12778 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXO1Q12778 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXO1Q12778 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXO1Q12778 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXO1Q12778 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FOXO1Q12778 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FOXO1Q12778 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXO1Q12778 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXO1Q12778 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXO1Q12778 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXO1Q12778 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXO1Q12778 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXO1Q12778 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXO1Q12778 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXO1Q12778 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXO1Q12778 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXO1Q12778 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXO1Q12778 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO1Q12778 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXO1Q12778 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXO1Q12778 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXO1Q12778 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXO1Q12778 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXO1Q12778 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXO1Q12778 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXO1Q12778 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXO1Q12778 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXO1Q12778 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOXO1Q12778 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXO1Q12778 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXO1Q12778 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXO1Q12778 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXO1Q12778 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FOXO1Q12778 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXO1Q12778 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXO1Q12778 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXO1Q12778 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXO1Q12778 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXO1Q12778 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXO1Q12778 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXO1Q12778 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXO1Q12778 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXO1Q12778 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXO1Q12778 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXO1Q12778 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXO1Q12778 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXO1Q12778 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXO1Q12778 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXO1Q12778 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXO1Q12778 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXO1Q12778 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXO1Q12778 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO1Q12778 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO1Q12778 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO1Q12778 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXO1Q12778 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXO1Q12778 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXO1Q12778 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
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