Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMAD3P84022 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMAD3P84022 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMAD3P84022 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMAD3P84022 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMAD3P84022 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMAD3P84022 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SMAD3P84022 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMAD3P84022 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SMAD3P84022 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SMAD3P84022 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMAD3P84022 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SMAD3P84022 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMAD3P84022 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMAD3P84022 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMAD3P84022 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMAD3P84022 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMAD3P84022 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SMAD3P84022 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMAD3P84022 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMAD3P84022 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMAD3P84022 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMAD3P84022 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMAD3P84022 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMAD3P84022 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMAD3P84022 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SMAD3P84022 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMAD3P84022 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMAD3P84022 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMAD3P84022 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMAD3P84022 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMAD3P84022 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMAD3P84022 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMAD3P84022 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMAD3P84022 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMAD3P84022 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMAD3P84022 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMAD3P84022 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMAD3P84022 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMAD3P84022 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMAD3P84022 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMAD3P84022 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMAD3P84022 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMAD3P84022 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMAD3P84022 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMAD3P84022 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMAD3P84022 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMAD3P84022 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMAD3P84022 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMAD3P84022 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMAD3P84022 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMAD3P84022 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMAD3P84022 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMAD3P84022 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMAD3P84022 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMAD3P84022 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMAD3P84022 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMAD3P84022 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMAD3P84022 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMAD3P84022 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SMAD3P84022 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMAD3P84022 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SMAD3P84022 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SMAD3P84022 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMAD3P84022 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMAD3P84022 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMAD3P84022 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMAD3P84022 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMAD3P84022 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMAD3P84022 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMAD3P84022 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMAD3P84022 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMAD3P84022 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMAD3P84022 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMAD3P84022 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMAD3P84022 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMAD3P84022 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMAD3P84022 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMAD3P84022 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms