Protein–RNA interactions for Protein: P68036

UBE2L3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2L3P68036 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE2L3P68036 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE2L3P68036 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE2L3P68036 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE2L3P68036 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE2L3P68036 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2L3P68036 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2L3P68036 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2L3P68036 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2L3P68036 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2L3P68036 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2L3P68036 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2L3P68036 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2L3P68036 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2L3P68036 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2L3P68036 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2L3P68036 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2L3P68036 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2L3P68036 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE2L3P68036 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2L3P68036 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2L3P68036 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2L3P68036 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2L3P68036 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2L3P68036 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2L3P68036 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2L3P68036 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2L3P68036 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2L3P68036 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2L3P68036 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2L3P68036 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBE2L3P68036 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBE2L3P68036 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2L3P68036 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2L3P68036 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBE2L3P68036 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE2L3P68036 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE2L3P68036 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE2L3P68036 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE2L3P68036 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2L3P68036 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2L3P68036 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2L3P68036 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2L3P68036 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2L3P68036 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2L3P68036 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE2L3P68036 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2L3P68036 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2L3P68036 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2L3P68036 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE2L3P68036 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2L3P68036 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE2L3P68036 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms