Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERVK_113P61574 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HERVK_113P61574 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P61574 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms