Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR4P51679 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR4P51679 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR4P51679 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR4P51679 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR4P51679 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR4P51679 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR4P51679 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR4P51679 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR4P51679 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR4P51679 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR4P51679 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR4P51679 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR4P51679 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR4P51679 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR4P51679 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCR4P51679 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR4P51679 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR4P51679 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR4P51679 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR4P51679 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR4P51679 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR4P51679 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR4P51679 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR4P51679 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR4P51679 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR4P51679 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR4P51679 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR4P51679 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR4P51679 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR4P51679 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR4P51679 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR4P51679 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR4P51679 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR4P51679 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR4P51679 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR4P51679 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR4P51679 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR4P51679 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCR4P51679 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR4P51679 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCR4P51679 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCR4P51679 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR4P51679 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR4P51679 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCR4P51679 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR4P51679 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCR4P51679 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR4P51679 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR4P51679 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCR4P51679 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR4P51679 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR4P51679 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCR4P51679 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR4P51679 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCR4P51679 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR4P51679 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR4P51679 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR4P51679 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR4P51679 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCR4P51679 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR4P51679 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR4P51679 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCR4P51679 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR4P51679 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR4P51679 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR4P51679 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR4P51679 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCR4P51679 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCR4P51679 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR4P51679 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR4P51679 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR4P51679 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR4P51679 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCR4P51679 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCR4P51679 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR4P51679 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR4P51679 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR4P51679 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR4P51679 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR4P51679 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR4P51679 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCR4P51679 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR4P51679 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR4P51679 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCR4P51679 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCR4P51679 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCR4P51679 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCR4P51679 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR4P51679 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR4P51679 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR4P51679 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR4P51679 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCR4P51679 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR4P51679 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR4P51679 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR4P51679 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR4P51679 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR4P51679 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCR4P51679 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms