Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCT4P50991 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCT4P50991 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCT4P50991 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCT4P50991 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCT4P50991 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCT4P50991 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCT4P50991 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCT4P50991 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCT4P50991 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCT4P50991 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
CCT4P50991 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCT4P50991 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCT4P50991 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCT4P50991 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCT4P50991 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCT4P50991 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCT4P50991 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCT4P50991 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCT4P50991 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCT4P50991 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCT4P50991 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCT4P50991 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CCT4P50991 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCT4P50991 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCT4P50991 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCT4P50991 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCT4P50991 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCT4P50991 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCT4P50991 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCT4P50991 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCT4P50991 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCT4P50991 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCT4P50991 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCT4P50991 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCT4P50991 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCT4P50991 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCT4P50991 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCT4P50991 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCT4P50991 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCT4P50991 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CCT4P50991 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCT4P50991 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCT4P50991 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCT4P50991 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCT4P50991 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCT4P50991 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCT4P50991 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCT4P50991 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CCT4P50991 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCT4P50991 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCT4P50991 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCT4P50991 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCT4P50991 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCT4P50991 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CCT4P50991 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCT4P50991 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCT4P50991 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCT4P50991 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CCT4P50991 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCT4P50991 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CCT4P50991 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCT4P50991 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCT4P50991 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCT4P50991 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCT4P50991 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCT4P50991 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCT4P50991 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCT4P50991 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCT4P50991 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCT4P50991 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCT4P50991 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCT4P50991 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCT4P50991 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCT4P50991 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCT4P50991 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCT4P50991 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCT4P50991 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CCT4P50991 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCT4P50991 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCT4P50991 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCT4P50991 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCT4P50991 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCT4P50991 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCT4P50991 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CCT4P50991 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCT4P50991 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCT4P50991 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCT4P50991 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCT4P50991 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCT4P50991 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCT4P50991 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCT4P50991 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCT4P50991 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCT4P50991 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CCT4P50991 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCT4P50991 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCT4P50991 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCT4P50991 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CCT4P50991 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms